35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5446 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5446  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  225  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 424 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  40 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  45.59 
 
 		 313 aa  63.9  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  39.33 
 
 		 358 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  41.56 
 
 		 253 aa  60.8  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  40 
 
 		 462 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2139  hypothetical protein  32.67 
 
 		 310 aa  57  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  35.92 
 
 		 437 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  40.91 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  46.43 
 
 		 306 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  36.89 
 
 		 309 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  32.98 
 
 		 307 aa  50.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  48.08 
 
 		 416 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  31.25 
 
 		 255 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2241  hypothetical protein  35.37 
 
 		 411 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  35.85 
 
 		 318 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  35.92 
 
 		 309 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  32.76 
 
 		 257 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  45.45 
 
 		 303 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  41.82 
 
 		 304 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2553  hypothetical protein  37.21 
 
 		 293 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  33.33 
 
 		 271 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  36.62 
 
 		 272 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  38.57 
 
 		 313 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  31.03 
 
 		 257 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  39.29 
 
 		 323 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  37.14 
 
 		 277 aa  42  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  34.94 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  34.18 
 
 		 252 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  32.73 
 
 		 257 aa  40.8  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  32.14 
 
 		 262 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00010  expressed protein  44.12 
 
 		 337 aa  40  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00326273  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  30 
 
 		 295 aa  40  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  33.78 
 
 		 265 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>