18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2241 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2241  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  850    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  40.62 
 
 		 266 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  37.84 
 
 		 231 aa  53.5  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  43.94 
 
 		 313 aa  53.1  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  45.16 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5446  hypothetical protein  35.37 
 
 		 108 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  34.04 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  45 
 
 		 306 aa  47  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  37.5 
 
 		 358 aa  47  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  51.06 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  25.44 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  33.04 
 
 		 309 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2139  hypothetical protein  30.43 
 
 		 310 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  25.29 
 
 		 260 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  28.25 
 
 		 308 aa  43.9  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  28.25 
 
 		 308 aa  43.9  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  40 
 
 		 309 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>