81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1252 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  100 
 
 		 306 aa  627  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  57.33 
 
 		 303 aa  365  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  51.61 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  48.87 
 
 		 315 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  51.8 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  51.15 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  42.81 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  40.69 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3143  hypothetical protein  28.23 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  35.66 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  32 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  32.28 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  30.33 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  31.71 
 
 		 323 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  31.01 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  26.25 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  31.78 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  38.6 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  39.32 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  34.17 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  30.57 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  35.71 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  32.5 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  29.13 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  29.75 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  43.84 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  28.99 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  31.4 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  27.49 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  33.61 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  28.21 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  34.71 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  34.71 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  34.71 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  35.63 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  35.25 
 
 		 496 aa  55.8  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  33.88 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  33.87 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  41.56 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  32.17 
 
 		 416 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00960  hypothetical protein  38.3 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  32.48 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  33.06 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1724  hypothetical protein  32.11 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.589368  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  33.06 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5446  hypothetical protein  46.43 
 
 		 108 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  26.36 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  29.17 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2760  restriction endonuclease-like protein  32.65 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  29.84 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  33.06 
 
 		 291 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  30.77 
 
 		 262 aa  52.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  29.57 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  25.17 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  30.89 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2139  hypothetical protein  33 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  28.33 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  32.23 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  30.83 
 
 		 333 aa  50.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  34.41 
 
 		 265 aa  50.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7809  hypothetical protein  29.51 
 
 		 298 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  34.52 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2553  hypothetical protein  31 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  32.88 
 
 		 375 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2241  hypothetical protein  45 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  30.36 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  27.62 
 
 		 180 aa  46.2  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3178  restriction endonuclease-like protein  30.77 
 
 		 213 aa  45.8  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  32.23 
 
 		 308 aa  45.8  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  32.23 
 
 		 308 aa  45.8  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  30 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  36.49 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  22.45 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  26.67 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  32.95 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  25.81 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  31.4 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  34.34 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  29.89 
 
 		 272 aa  43.5  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  31.33 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>