72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0191 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  628  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  628  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  76.05 
 
 
308 aa  475  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00960  hypothetical protein  40 
 
 
318 aa  186  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  39.56 
 
 
297 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  33.58 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0819  hypothetical protein  36.45 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.607304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0835  hypothetical protein  36.45 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  33.54 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  36.51 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  33.67 
 
 
257 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3186  restriction endonuclease-like protein  32.19 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  34.44 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  39.06 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  31.25 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  29.89 
 
 
496 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  33.59 
 
 
265 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  37.7 
 
 
318 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  36.97 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  36.43 
 
 
291 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  37.5 
 
 
291 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  36.04 
 
 
291 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6708  hypothetical protein  40.23 
 
 
376 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.292072 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  36.59 
 
 
298 aa  57  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  35.14 
 
 
290 aa  56.6  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  30.88 
 
 
271 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  21.88 
 
 
318 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  38.76 
 
 
313 aa  56.2  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  38.04 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  38.04 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  38.04 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  38.04 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  37.5 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  39.08 
 
 
326 aa  53.5  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  38.04 
 
 
283 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  30.94 
 
 
256 aa  53.1  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  36.67 
 
 
263 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  34.13 
 
 
462 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  35.23 
 
 
295 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  34.35 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2553  hypothetical protein  35.79 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  35 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  28.15 
 
 
313 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20450  hypothetical protein with putative HNH endonuclease motif  36.99 
 
 
175 aa  50.8  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  33.72 
 
 
358 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  38.27 
 
 
258 aa  50.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  32.56 
 
 
298 aa  50.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  37.93 
 
 
326 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  36 
 
 
299 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  28.57 
 
 
345 aa  50.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  35.59 
 
 
272 aa  49.7  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  33.33 
 
 
289 aa  49.3  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  35.63 
 
 
374 aa  49.3  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  27.73 
 
 
323 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  36.96 
 
 
304 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
424 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0039  hypothetical protein  41.1 
 
 
123 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  43.37 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  35.16 
 
 
265 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  33.05 
 
 
326 aa  46.2  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7809  hypothetical protein  36.47 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  41.38 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  30.77 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  32.23 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  32.18 
 
 
304 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  36.56 
 
 
180 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  33.75 
 
 
266 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  32.58 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  32.48 
 
 
304 aa  43.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  32.77 
 
 
256 aa  42.7  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3143  hypothetical protein  38.36 
 
 
248 aa  42.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2241  hypothetical protein  32.35 
 
 
411 aa  42.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>