70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2980 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  631  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  76.7 
 
 		 308 aa  481  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  76.7 
 
 		 308 aa  481  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00960  hypothetical protein  39.72 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  36.88 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0819  hypothetical protein  35.66 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.607304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0835  hypothetical protein  35.66 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  32.93 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  33.14 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  27.08 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  36.67 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  31.82 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  37.5 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  27.95 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  36.84 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  34.29 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3186  restriction endonuclease-like protein  36.67 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  29.57 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  37.59 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  29.51 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  38.6 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  35.07 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  30.92 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6708  hypothetical protein  40.23 
 
 		 376 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.292072 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  35.71 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  32.86 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  33.6 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  36.05 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  25 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  29.82 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  30.3 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  35.14 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  35.14 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  30.37 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  34.82 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  37.14 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20450  hypothetical protein with putative HNH endonuclease motif  35.06 
 
 		 175 aa  53.5  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  38.53 
 
 		 263 aa  53.1  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0039  hypothetical protein  44.44 
 
 		 123 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  40.48 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  30.22 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2553  hypothetical protein  36.17 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  30.77 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  34.82 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  33.06 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  26.77 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  36.56 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  36.56 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  36.56 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  32.48 
 
 		 326 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  35.16 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  32.5 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  36.59 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  37.63 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  32.38 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 374 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  37.5 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  39.74 
 
 		 231 aa  47  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 424 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  33.6 
 
 		 299 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  30.83 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3143  hypothetical protein  33.68 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  30 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  30.4 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  30.77 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  26.89 
 
 		 323 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  32.58 
 
 		 279 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2760  restriction endonuclease-like protein  28.18 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  35.16 
 
 		 272 aa  42.7  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  32.73 
 
 		 319 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>