30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6708 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6708  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  780    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.292072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  40.23 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  40.23 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  43.02 
 
 		 462 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  40.23 
 
 		 308 aa  57  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  32 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  38.71 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  34.44 
 
 		 266 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  35 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  30.61 
 
 		 309 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  30.93 
 
 		 309 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  25 
 
 		 277 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1724  hypothetical protein  32.38 
 
 		 309 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.589368  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  26.03 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  31.68 
 
 		 260 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  33 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  33.73 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3143  hypothetical protein  43.66 
 
 		 248 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  29.84 
 
 		 256 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  35.14 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  36.05 
 
 		 318 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  36.62 
 
 		 213 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  29.31 
 
 		 262 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  36.84 
 
 		 231 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  31.91 
 
 		 253 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  31.52 
 
 		 265 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  27.87 
 
 		 313 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  31.29 
 
 		 263 aa  43.1  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>