21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1724 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1724  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  634    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.589368  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  36.45 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  37.36 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  33.05 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  40.43 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  32.11 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  31.53 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  39.24 
 
 		 304 aa  49.3  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6708  hypothetical protein  32.38 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.292072 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2553  hypothetical protein  31.86 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  34.62 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  37.04 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  32.53 
 
 		 309 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  30.53 
 
 		 258 aa  45.8  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  24.69 
 
 		 265 aa  45.8  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  35.37 
 
 		 462 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  31.37 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  34.23 
 
 		 266 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  30.38 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  27.61 
 
 		 345 aa  42.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>