43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2553 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2553  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  602  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  31.77 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  40.21 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2139  hypothetical protein  38.83 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  38 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  38 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  36.89 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  28.87 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  36.46 
 
 		 437 aa  62.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  30.33 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  35.79 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  31 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  30.19 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  35.79 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5446  hypothetical protein  37.21 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  35.79 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  36.17 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1724  hypothetical protein  31.86 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.589368  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  31.25 
 
 		 231 aa  53.1  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  30.1 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  30.41 
 
 		 265 aa  52.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  23.44 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  24.19 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  33.71 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  23.44 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  31.19 
 
 		 416 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  23.44 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  25 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  23.08 
 
 		 297 aa  49.7  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  26.19 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6708  hypothetical protein  32.18 
 
 		 376 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.292072 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  27.08 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  28.32 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3143  hypothetical protein  30.93 
 
 		 248 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  22.58 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  22.58 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  24.19 
 
 		 375 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  21.88 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  30.95 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  27.43 
 
 		 313 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  22.13 
 
 		 298 aa  42.7  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1505  hypothetical protein  35.94 
 
 		 148 aa  42.7  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>