73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4688 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  100 
 
 		 319 aa  661    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  30.61 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  30.7 
 
 		 323 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  32.18 
 
 		 374 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  29.56 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  27.36 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  30.77 
 
 		 326 aa  122  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  30.87 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  26.49 
 
 		 297 aa  89.7  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  26.09 
 
 		 290 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  26.51 
 
 		 290 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  26.51 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  34.11 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  32.56 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  31.4 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  30.13 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  33.33 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  24.42 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  36.81 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  32.5 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  33.11 
 
 		 496 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  26.13 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  29.56 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  24.36 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  30.33 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  30.65 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  22.92 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3178  restriction endonuclease-like protein  33.33 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  34.78 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  28.4 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  31.71 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  31.71 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  23.47 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  21.57 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  34.78 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  33.08 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  32.8 
 
 		 265 aa  57  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7809  hypothetical protein  24.53 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20450  hypothetical protein with putative HNH endonuclease motif  37.5 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3143  hypothetical protein  28.03 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 424 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00960  hypothetical protein  33.66 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  29.23 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3186  restriction endonuclease-like protein  32.58 
 
 		 326 aa  53.5  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  35.71 
 
 		 340 aa  53.1  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  30.25 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2760  restriction endonuclease-like protein  27.09 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  33 
 
 		 255 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  28.93 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  28.57 
 
 		 462 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  26.02 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  29.84 
 
 		 256 aa  50.4  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  31.53 
 
 		 262 aa  50.1  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  28.23 
 
 		 260 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3491  SRA-YDG domain-containing protein  29.7 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.205725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  37.04 
 
 		 313 aa  49.7  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  29.03 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1229  SRA-YDG domain protein  30.43 
 
 		 289 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  33.85 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  27.69 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  27.91 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  39.22 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  27.89 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  51.52 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  26.5 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0150  HNH endonuclease  27.66 
 
 		 223 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.550469  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1849  hypothetical protein  23.77 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00822295  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  33.63 
 
 		 252 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  27.69 
 
 		 271 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  32.73 
 
 		 308 aa  42.7  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2139  hypothetical protein  24.69 
 
 		 310 aa  42.7  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1723  HNH endonuclease  25.14 
 
 		 407 aa  42.4  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>