23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1229 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1229  SRA-YDG domain protein  100 
 
 
289 aa  594  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3491  SRA-YDG domain-containing protein  46.62 
 
 
309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.205725  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1577  SRA-YDG domain-containing protein  48.58 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06550  conserved hypothetical protein  44.52 
 
 
165 aa  110  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0982695  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5551  restriction endonuclease-like protein  42.61 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.945122  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1723  HNH endonuclease  37.5 
 
 
407 aa  84  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0150  HNH endonuclease  40 
 
 
223 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.550469  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  40.23 
 
 
496 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  30.34 
 
 
340 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  24.84 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  35.48 
 
 
333 aa  49.7  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  30.43 
 
 
319 aa  49.3  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  36.14 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  36.19 
 
 
242 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  32.5 
 
 
290 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3178  restriction endonuclease-like protein  27.33 
 
 
213 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  29.31 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  29.31 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  29.6 
 
 
304 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  36.84 
 
 
291 aa  42.7  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  26.09 
 
 
290 aa  42.7  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  29.7 
 
 
299 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>