17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5551 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5551  restriction endonuclease-like protein  100 
 
 		 251 aa  508  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.945122  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1577  SRA-YDG domain-containing protein  49.14 
 
 		 290 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3491  SRA-YDG domain-containing protein  42.98 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.205725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1229  SRA-YDG domain protein  42.61 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0150  HNH endonuclease  36.44 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.550469  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1210  hypothetical protein  49.4 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4566  hypothetical protein  47.67 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  46.07 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1723  HNH endonuclease  31.97 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3530  hypothetical protein  39.05 
 
 		 150 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.981838 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  30.77 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2074  hypothetical protein  39.52 
 
 		 165 aa  52.4  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285964  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0812  hypothetical protein  37.21 
 
 		 82 aa  48.9  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.25846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0350  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  32.98 
 
 		 687 aa  45.8  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  47.46 
 
 		 290 aa  45.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  31.33 
 
 		 340 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  35.21 
 
 		 326 aa  42  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>