29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3491 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3491  SRA-YDG domain-containing protein  100 
 
 		 309 aa  633  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.205725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1577  SRA-YDG domain-containing protein  50.34 
 
 		 290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1229  SRA-YDG domain protein  46.62 
 
 		 289 aa  273  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5551  restriction endonuclease-like protein  42.98 
 
 		 251 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.945122  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0150  HNH endonuclease  39.17 
 
 		 223 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.550469  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06550  conserved hypothetical protein  38.75 
 
 		 165 aa  88.6  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0982695  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1723  HNH endonuclease  35.48 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  35.4 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  28.25 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  41.79 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  27.27 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  29.7 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  34.15 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  29.91 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  34.15 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  24.43 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3178  restriction endonuclease-like protein  32.28 
 
 		 213 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  27.42 
 
 		 333 aa  45.8  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  28.57 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49981  predicted protein  31.85 
 
 		 544 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000710505  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  31.65 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  31.65 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  27.43 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  30.12 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  27.43 
 
 		 290 aa  43.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  31.71 
 
 		 374 aa  43.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2123  hypothetical protein  37.14 
 
 		 268 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203895  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  27.43 
 
 		 290 aa  43.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1959  HNH endonuclease  34.94 
 
 		 334 aa  42.4  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>