20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2123 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2123  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  556  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203895  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  32.59 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  30.77 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  35.96 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1723  HNH endonuclease  27.92 
 
 		 407 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  34.67 
 
 		 303 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  28.18 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  25.33 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  32.89 
 
 		 220 aa  47  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  37.1 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  41.43 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  27.64 
 
 		 237 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  27.17 
 
 		 116 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3491  SRA-YDG domain-containing protein  37.14 
 
 		 309 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.205725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  28.38 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  29.87 
 
 		 330 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3203  hypothetical protein  33.87 
 
 		 295 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000490402  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  28.43 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  35 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2792  HNH endonuclease  28.3 
 
 		 233 aa  42.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>