34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00169 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  100 
 
 		 116 aa  240  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  57.94 
 
 		 240 aa  134  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  50 
 
 		 220 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  54.05 
 
 		 240 aa  122  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  55.56 
 
 		 260 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  54.32 
 
 		 226 aa  100  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  43.75 
 
 		 242 aa  96.7  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  53.09 
 
 		 330 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  53.16 
 
 		 277 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  47.5 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  40.66 
 
 		 282 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  43.21 
 
 		 309 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  49.28 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2792  HNH endonuclease  43.21 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  49.12 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1083  HNH endonuclease  41.89 
 
 		 279 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0692157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  38.54 
 
 		 395 aa  54.3  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4026  hypothetical protein  41.82 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7830  hypothetical protein  48.44 
 
 		 419 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6329  HNH endonuclease typeIV restriction enzyme  36.14 
 
 		 348 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523824  hitchhiker  0.00205362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4628  HNH endonuclease  41.1 
 
 		 323 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0677  HNH nuclease  35.96 
 
 		 309 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.872513  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2123  hypothetical protein  27.17 
 
 		 268 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203895  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0977  HNH endonuclease  50 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.592566  hitchhiker  0.000615877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1632  HNH endonuclease  33.67 
 
 		 388 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3203  hypothetical protein  27.5 
 
 		 295 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000490402  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  28.57 
 
 		 340 aa  41.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1300  HNH endonuclease  32.29 
 
 		 316 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0239  HNH endonuclease  35.82 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.628589  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 549 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  34.34 
 
 		 234 aa  40.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4158  HNH endonuclease  34.83 
 
 		 388 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  40.74 
 
 		 561 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  48.39 
 
 		 568 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>