36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4228 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  100 
 
 		 242 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  54.35 
 
 		 330 aa  265  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  50.45 
 
 		 226 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  40.35 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  50.43 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  64 
 
 		 260 aa  98.6  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  51.55 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  43.75 
 
 		 116 aa  96.7  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  50 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  41.07 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2792  HNH endonuclease  33.57 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  43.37 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  33.61 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  34.15 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  39.51 
 
 		 84 aa  72  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4026  hypothetical protein  47.17 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2835  hypothetical protein  48 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.868461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1083  HNH endonuclease  43.84 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0692157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2083  hypothetical protein  44.74 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.064212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4628  HNH endonuclease  36.78 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3808  hypothetical protein  42.67 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6329  HNH endonuclease typeIV restriction enzyme  36.94 
 
 		 348 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523824  hitchhiker  0.00205362 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3496  hypothetical protein  41.33 
 
 		 335 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2123  hypothetical protein  30.77 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203895  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  35.96 
 
 		 395 aa  52.4  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0150  HNH endonuclease  31.82 
 
 		 223 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.550469  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3203  hypothetical protein  29.2 
 
 		 295 aa  52  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000490402  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4566  hypothetical protein  38.96 
 
 		 380 aa  52  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1229  SRA-YDG domain protein  36.19 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3167  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 177 aa  45.8  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1210  hypothetical protein  35.06 
 
 		 395 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  26.76 
 
 		 340 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7830  hypothetical protein  37.65 
 
 		 419 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1999  hypothetical protein  35.9 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214007  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31890  Retron-type reverse transcriptase protein  41.38 
 
 		 65 aa  42.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0824  HNH endonuclease  25.21 
 
 		 276 aa  42  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00962018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>