22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1999 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1999  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  570  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214007  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3496  hypothetical protein  76.62 
 
 
335 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2083  hypothetical protein  75.54 
 
 
278 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.064212 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3808  hypothetical protein  76.26 
 
 
278 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2835  hypothetical protein  73.74 
 
 
277 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.868461  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0002  hypothetical protein  39.49 
 
 
277 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1210  hypothetical protein  38.63 
 
 
395 aa  172  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4566  hypothetical protein  40.14 
 
 
380 aa  168  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1176  hypothetical protein  35.56 
 
 
302 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.127226 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1919  hypothetical protein  40 
 
 
576 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  unclonable  0.0000000000840766  unclonable  7.47349e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2311  hypothetical protein  40.91 
 
 
595 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000201823  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1013  hypothetical protein  35.71 
 
 
393 aa  92  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132535  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0468  hypothetical protein  44.44 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.745097  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3223  hypothetical protein  33.08 
 
 
498 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  30.41 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0025  hypothetical protein  21.67 
 
 
418 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000254674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0025  hypothetical protein  21.67 
 
 
418 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000509485  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2528  hypothetical protein  21.67 
 
 
431 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000441271  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  33.77 
 
 
226 aa  45.4  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2928  putative hexulose 6 phosphate synthase  37.35 
 
 
400 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000179254 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C04  hypothetical protein  37.97 
 
 
345 aa  43.5  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  35.9 
 
 
242 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>