37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1083 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1083  HNH endonuclease  100 
 
 		 279 aa  571  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0692157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6329  HNH endonuclease typeIV restriction enzyme  52.68 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523824  hitchhiker  0.00205362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4628  HNH endonuclease  53.21 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  33.06 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  41.03 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  40.24 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2792  HNH endonuclease  32.41 
 
 		 233 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  43.18 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  43.84 
 
 		 242 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  34.78 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  48.53 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  41.89 
 
 		 116 aa  55.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  39.24 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  35.05 
 
 		 260 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  39.53 
 
 		 395 aa  52.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  34.94 
 
 		 84 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  37.93 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  40.58 
 
 		 240 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0924  hypothetical protein  27.63 
 
 		 150 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.396091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 424 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0769  hypothetical protein  28.29 
 
 		 152 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2011  hypothetical protein  28.29 
 
 		 152 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3063  hypothetical protein  28.29 
 
 		 152 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3010  hypothetical protein  28.29 
 
 		 152 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2602  hypothetical protein  28.29 
 
 		 152 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1544  hypothetical protein  27.63 
 
 		 172 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4066  hypothetical protein  27.63 
 
 		 154 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3098  hypothetical protein  28.29 
 
 		 152 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2141  hypothetical protein  28.29 
 
 		 152 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0823  hypothetical protein  26.97 
 
 		 150 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3203  hypothetical protein  40.35 
 
 		 295 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000490402  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0962  hypothetical protein  26.97 
 
 		 150 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0483  hypothetical protein  26.97 
 
 		 150 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2154  HNH endonuclease  22.97 
 
 		 297 aa  42.7  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116286  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0623  hypothetical protein  26.45 
 
 		 216 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0897  hypothetical protein  28.95 
 
 		 181 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>