27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3203 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3203  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  614  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000490402  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  35.96 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  43.33 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  38.27 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  29.2 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  31.08 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  32.1 
 
 		 260 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  34.41 
 
 		 285 aa  48.9  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  26 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  35.38 
 
 		 277 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  31.18 
 
 		 281 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  24.48 
 
 		 247 aa  46.6  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  27.1 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  33.82 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  26.13 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  27.1 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  25 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1723  HNH endonuclease  29.29 
 
 		 407 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  32.05 
 
 		 266 aa  43.9  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1083  HNH endonuclease  40.35 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0692157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  35 
 
 		 282 aa  43.1  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_010718  Nther_0803  HNH endonuclease  32.2 
 
 		 232 aa  42.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000235638  hitchhiker  0.00421341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4943  hypothetical protein  29.27 
 
 		 283 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  27.5 
 
 		 116 aa  42.7  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3152  McrA  40.48 
 
 		 45 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.242791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2123  hypothetical protein  33.87 
 
 		 268 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203895  normal  0.77649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>