20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6329 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6329  HNH endonuclease typeIV restriction enzyme  100 
 
 		 348 aa  712    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523824  hitchhiker  0.00205362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4628  HNH endonuclease  49.06 
 
 		 323 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1083  HNH endonuclease  52.68 
 
 		 279 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0692157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  25.39 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  35.64 
 
 		 237 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  36.07 
 
 		 330 aa  67  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  33.33 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  39 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  39.08 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2792  HNH endonuclease  34.02 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  36.94 
 
 		 242 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  40.26 
 
 		 84 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  34.44 
 
 		 282 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  40.79 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  34.83 
 
 		 309 aa  52.8  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  36.14 
 
 		 116 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 240 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  36.14 
 
 		 240 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  35.35 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0879  HNH endonuclease family protein  32.79 
 
 		 182 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00646503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>