43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1215 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  100 
 
 		 260 aa  531  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  57.83 
 
 		 330 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  57.5 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  55.56 
 
 		 116 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  64 
 
 		 242 aa  98.6  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  58.67 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  51.22 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  53.09 
 
 		 240 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  57.53 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  44.94 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  30.71 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2792  HNH endonuclease  27.4 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  36.28 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  52.63 
 
 		 84 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  48.28 
 
 		 395 aa  58.9  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4026  hypothetical protein  46.3 
 
 		 122 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  39.29 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6329  HNH endonuclease typeIV restriction enzyme  40.79 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523824  hitchhiker  0.00205362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1083  HNH endonuclease  35.05 
 
 		 279 aa  52  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0692157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4628  HNH endonuclease  41.43 
 
 		 323 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3203  hypothetical protein  32.1 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000490402  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1723  HNH endonuclease  28.81 
 
 		 407 aa  49.3  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  21.56 
 
 		 340 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 163 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  32.1 
 
 		 387 aa  45.8  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  32.1 
 
 		 388 aa  45.8  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0977  HNH endonuclease  42.11 
 
 		 200 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.592566  hitchhiker  0.000615877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7830  hypothetical protein  43.1 
 
 		 419 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1016  DNA helicase, putative  30.14 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.93737e-37 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  29.81 
 
 		 560 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3167  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 177 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0677  HNH nuclease  35.59 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.872513  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  29.81 
 
 		 560 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0030  hypothetical protein  28.33 
 
 		 95 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0824  HNH endonuclease  28.79 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00962018  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  50 
 
 		 115 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2123  hypothetical protein  28.38 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203895  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  39.58 
 
 		 118 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0706  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 255 aa  42  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.543261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2799  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 309 aa  42  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00129487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  34.21 
 
 		 116 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  27.62 
 
 		 247 aa  42  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>