14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4026 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4026  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  253  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  47.17 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  47.17 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  45.28 
 
 
237 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  47.17 
 
 
330 aa  60.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  46.3 
 
 
260 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  38.1 
 
 
240 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  41.82 
 
 
116 aa  53.9  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  43.4 
 
 
240 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  43.64 
 
 
220 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  37.74 
 
 
277 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  36.36 
 
 
282 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  33.93 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4628  HNH endonuclease  41.38 
 
 
323 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>