27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02910 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  100 
 
 		 395 aa  802    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1210  hypothetical protein  48.94 
 
 		 395 aa  86.3  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7830  hypothetical protein  47.78 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4566  hypothetical protein  48.91 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5551  restriction endonuclease-like protein  46.07 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.945122  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  26.04 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  39.33 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  48.28 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  36.44 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  32.41 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0824  HNH endonuclease  36.08 
 
 		 276 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00962018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  39.33 
 
 		 240 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1016  DNA helicase, putative  58.54 
 
 		 278 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.93737e-37 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  38.54 
 
 		 116 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 237 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  40.85 
 
 		 220 aa  53.1  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  34.12 
 
 		 84 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  35.96 
 
 		 242 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1083  HNH endonuclease  39.53 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0692157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  31.86 
 
 		 240 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  28.85 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6329  HNH endonuclease typeIV restriction enzyme  35.35 
 
 		 348 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523824  hitchhiker  0.00205362 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0977  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 200 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.592566  hitchhiker  0.000615877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4628  HNH endonuclease  44.59 
 
 		 323 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  38.1 
 
 		 118 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  28.28 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2792  HNH endonuclease  29.03 
 
 		 233 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>