33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0033 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  461  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  58.56 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  50 
 
 		 116 aa  125  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  41.41 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  57.5 
 
 		 260 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  46.3 
 
 		 330 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  45.1 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  51.76 
 
 		 277 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  50 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  46.32 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  53.62 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  34.56 
 
 		 309 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2792  HNH endonuclease  42.35 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  50.88 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3203  hypothetical protein  35.96 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000490402  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6329  HNH endonuclease typeIV restriction enzyme  39.08 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523824  hitchhiker  0.00205362 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  40.85 
 
 		 395 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4628  HNH endonuclease  37.65 
 
 		 323 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4026  hypothetical protein  43.64 
 
 		 122 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1083  HNH endonuclease  40 
 
 		 279 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0692157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  28.21 
 
 		 340 aa  47  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2123  hypothetical protein  32.89 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203895  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  36.11 
 
 		 388 aa  45.4  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0666  HNH endonuclease  31.82 
 
 		 282 aa  45.4  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000029476  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0030  hypothetical protein  35.85 
 
 		 95 aa  45.1  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  36.11 
 
 		 387 aa  44.3  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  28.57 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7830  hypothetical protein  43.1 
 
 		 419 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1851  HNH endonuclease  34.38 
 
 		 120 aa  42.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3167  HNH endonuclease  24.81 
 
 		 177 aa  42.4  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1061  HNH endonuclease  38.6 
 
 		 118 aa  41.6  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>