34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0290 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  100 
 
 		 281 aa  578  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  35.38 
 
 		 281 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  50.98 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  50 
 
 		 224 aa  116  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  47.47 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  33.69 
 
 		 213 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  34.67 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  44 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2154  HNH endonuclease  54.55 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116286  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  40.31 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2957  HNH endonuclease  39.17 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1637  restriction endonuclease-like protein  46.08 
 
 		 314 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1508  HNH endonuclease  43.97 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  35.57 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  38.05 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  43.56 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  47.25 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1428  restriction endonuclease-like protein  42.86 
 
 		 212 aa  95.5  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.352885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3214  HNH endonuclease  38.84 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0803  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000235638  hitchhiker  0.00421341 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  47.14 
 
 		 211 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  47.14 
 
 		 211 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2060  HNH endonuclease  34.52 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  40.85 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  30.95 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0587  hypothetical protein  44.83 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4943  hypothetical protein  44.83 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2534  HNH endonuclease  35.79 
 
 		 426 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  35.05 
 
 		 277 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0666  HNH endonuclease  41.07 
 
 		 282 aa  49.3  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000029476  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  30.34 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3203  hypothetical protein  31.18 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000490402  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  30.26 
 
 		 330 aa  42  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>