25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2792 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2792  HNH endonuclease  100 
 
 		 233 aa  485  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  65.42 
 
 		 303 aa  165  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  35.16 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  33.57 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  39.78 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  27.4 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  35.05 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  33.98 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  40.43 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  42.5 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_010571  Oter_1083  HNH endonuclease  30.51 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0692157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  41.98 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  42.35 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  36 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  43.21 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4628  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6329  HNH endonuclease typeIV restriction enzyme  34.02 
 
 		 348 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523824  hitchhiker  0.00205362 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  39.44 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1959  HNH endonuclease  31.52 
 
 		 334 aa  46.6  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0150  HNH endonuclease  30.68 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.550469  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1723  HNH endonuclease  24.35 
 
 		 407 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  29.03 
 
 		 395 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2123  hypothetical protein  28.3 
 
 		 268 aa  42.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203895  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  37.1 
 
 		 290 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>