23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1723 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1723  HNH endonuclease  100 
 
 		 407 aa  838    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0150  HNH endonuclease  41.32 
 
 		 223 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.550469  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1577  SRA-YDG domain-containing protein  40.68 
 
 		 290 aa  86.3  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3491  SRA-YDG domain-containing protein  35.48 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.205725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1229  SRA-YDG domain protein  37.5 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5551  restriction endonuclease-like protein  31.97 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.945122  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  30.7 
 
 		 340 aa  54.3  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  30 
 
 		 318 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  37.97 
 
 		 496 aa  53.5  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  29.48 
 
 		 290 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2123  hypothetical protein  27.92 
 
 		 268 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203895  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  29.73 
 
 		 313 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  28.81 
 
 		 260 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  37.8 
 
 		 323 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  31.15 
 
 		 297 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0666  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 282 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000029476  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  34.23 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  31.19 
 
 		 290 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  31.19 
 
 		 290 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2792  HNH endonuclease  24.35 
 
 		 233 aa  43.9  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3203  hypothetical protein  29.29 
 
 		 295 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000490402  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  31.33 
 
 		 299 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>