68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0581 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  100 
 
 
323 aa  669    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  40.13 
 
 
374 aa  225  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  37.42 
 
 
326 aa  208  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  37.82 
 
 
326 aa  206  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  39.27 
 
 
326 aa  200  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  34.73 
 
 
313 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  30.7 
 
 
319 aa  155  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  32 
 
 
318 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  27.59 
 
 
290 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2760  restriction endonuclease-like protein  28.01 
 
 
304 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  27.57 
 
 
291 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  27.3 
 
 
291 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  39.2 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  27.42 
 
 
297 aa  90.1  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  28.71 
 
 
333 aa  90.5  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  27 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  38.4 
 
 
299 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  24.83 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  24.66 
 
 
290 aa  87  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  24.83 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  36.09 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  27.63 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  35.66 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7809  hypothetical protein  24.83 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  37.3 
 
 
496 aa  82.8  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  35.48 
 
 
263 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3178  restriction endonuclease-like protein  35.83 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  36.61 
 
 
257 aa  79  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  24.03 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20450  hypothetical protein with putative HNH endonuclease motif  35.48 
 
 
175 aa  75.5  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  24.91 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  35.25 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  30.34 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  29.75 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  31.71 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  29.27 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 
424 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  21.95 
 
 
304 aa  62.4  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  32.2 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  30.14 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  28.93 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1849  hypothetical protein  24.02 
 
 
304 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00822295  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3186  restriction endonuclease-like protein  36.25 
 
 
326 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  29.37 
 
 
253 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  28.1 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  29.32 
 
 
256 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  34.51 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00960  hypothetical protein  38.96 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  34.15 
 
 
257 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  27.69 
 
 
265 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  27.13 
 
 
271 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3973  hypothetical protein  28.57 
 
 
309 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  34.48 
 
 
266 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  34.71 
 
 
231 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  33.66 
 
 
313 aa  51.6  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  33.75 
 
 
263 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  24.44 
 
 
260 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  27.73 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  27.73 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1723  HNH endonuclease  37.8 
 
 
407 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  28.97 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  25.58 
 
 
345 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1577  SRA-YDG domain-containing protein  38.27 
 
 
290 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  27.43 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  34.15 
 
 
358 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3143  hypothetical protein  29.41 
 
 
248 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  29.5 
 
 
268 aa  42.7  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5446  hypothetical protein  39.29 
 
 
108 aa  42.4  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.141898 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>