91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3867 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  100 
 
 
309 aa  633  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  95.13 
 
 
309 aa  603  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  60.95 
 
 
315 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  50.82 
 
 
306 aa  271  9e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  44.66 
 
 
303 aa  269  5e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  44.26 
 
 
304 aa  256  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  40.19 
 
 
318 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  42.12 
 
 
313 aa  181  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  46.9 
 
 
462 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  32.68 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  31.76 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
424 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  37.21 
 
 
253 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  34.96 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  30.26 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  46.84 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  38.41 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  37.04 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  24.84 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  32.76 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  27.59 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  32.35 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  37.93 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  34.92 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  45.21 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  29.41 
 
 
262 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  34.44 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  32.35 
 
 
299 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  34.44 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2760  restriction endonuclease-like protein  34.65 
 
 
304 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  31.71 
 
 
319 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  31.43 
 
 
416 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  42.05 
 
 
259 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00960  hypothetical protein  36.75 
 
 
318 aa  62.8  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  31.11 
 
 
260 aa  62.4  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  31.97 
 
 
291 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  27.78 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  28.46 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  31.97 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  36.97 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3143  hypothetical protein  33.98 
 
 
248 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2553  hypothetical protein  38 
 
 
293 aa  60.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  28.22 
 
 
265 aa  59.7  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7809  hypothetical protein  33.06 
 
 
298 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  35.25 
 
 
496 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  31.97 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  28.1 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  33.61 
 
 
290 aa  57.8  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  31.09 
 
 
290 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  31.09 
 
 
290 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  31.4 
 
 
375 aa  56.6  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  31.09 
 
 
290 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  38.64 
 
 
272 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  31.58 
 
 
279 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2139  hypothetical protein  34.52 
 
 
310 aa  56.2  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  37.23 
 
 
265 aa  56.2  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  25.22 
 
 
263 aa  55.8  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  36.9 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  31.67 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  30.32 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  29.5 
 
 
326 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  30.1 
 
 
345 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  28.15 
 
 
263 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  31.82 
 
 
437 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  44.93 
 
 
231 aa  53.1  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  28.17 
 
 
297 aa  53.1  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  30.33 
 
 
374 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  34.09 
 
 
180 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  32 
 
 
298 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5446  hypothetical protein  36.89 
 
 
108 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  26.09 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3178  restriction endonuclease-like protein  31.9 
 
 
213 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6708  hypothetical protein  30.93 
 
 
376 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.292072 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  25.63 
 
 
326 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  33.73 
 
 
295 aa  49.3  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1397  hypothetical protein  58.06 
 
 
177 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3186  restriction endonuclease-like protein  32.76 
 
 
326 aa  49.3  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1849  hypothetical protein  31.67 
 
 
304 aa  49.3  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00822295  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  33.87 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  33.73 
 
 
311 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1724  hypothetical protein  37.04 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.589368  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  30.25 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  27.19 
 
 
313 aa  47  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  27.08 
 
 
323 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  35.23 
 
 
315 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  29 
 
 
326 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  30.19 
 
 
283 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  29.23 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0565  hypothetical protein  47.22 
 
 
322 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2241  hypothetical protein  40 
 
 
411 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0625  hypothetical protein  23.58 
 
 
282 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>