51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2246 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  667    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3983  hypothetical protein  51.71 
 
 		 323 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.612254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  49.23 
 
 		 328 aa  319  5e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  39.12 
 
 		 311 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  38.7 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  51.61 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  39.23 
 
 		 314 aa  99.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  40 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  39.13 
 
 		 277 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  39.13 
 
 		 252 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  37.41 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  36.07 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  36.07 
 
 		 304 aa  86.3  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  38.46 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  34.59 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  31.5 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  35.56 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  38.52 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  39.47 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  38.6 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0625  hypothetical protein  37.1 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  40.17 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  38.57 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  35.29 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  43.18 
 
 		 265 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  34.81 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  34.56 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1365  hypothetical protein  27.52 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  36.89 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6007  putative restriction endonuclease  26.13 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  29.79 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  29.75 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  27.92 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  36.36 
 
 		 416 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  46.43 
 
 		 271 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4145  hypothetical protein  23.83 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  36.59 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  27.34 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  27.08 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  35.42 
 
 		 255 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  41.49 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  27.08 
 
 		 309 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2311  hypothetical protein  24.66 
 
 		 595 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000201823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  30.07 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  26.32 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  27.94 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1724  hypothetical protein  31.37 
 
 		 309 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.589368  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  29.91 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  32.28 
 
 		 462 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  27.27 
 
 		 299 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>