86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3723 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  600  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  40.27 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7809  hypothetical protein  39.73 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2760  restriction endonuclease-like protein  43.66 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  35.93 
 
 		 298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  32.89 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  32.57 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1849  hypothetical protein  35.41 
 
 		 304 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00822295  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  29.08 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  29.97 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  32.59 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  29.97 
 
 		 290 aa  146  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  31.35 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  28.99 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  29.51 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  28.47 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  34.68 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  27.12 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  26.83 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  24.75 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  28.04 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  22.26 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  33.81 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  36.36 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  37.62 
 
 		 496 aa  66.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  27.91 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  21.57 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  30.28 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  31.67 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  32.77 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  32.52 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  31.71 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  27.49 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3178  restriction endonuclease-like protein  31.93 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  33.33 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  32.35 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  32.06 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  29.27 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  25.98 
 
 		 298 aa  52.8  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  25.63 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3186  restriction endonuclease-like protein  28.37 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  33.06 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  28.57 
 
 		 256 aa  49.3  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  24.35 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20450  hypothetical protein with putative HNH endonuclease motif  40.54 
 
 		 175 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  36.84 
 
 		 436 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  38.6 
 
 		 435 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  29.17 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  38.6 
 
 		 435 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  38.6 
 
 		 440 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  35.09 
 
 		 434 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  36.84 
 
 		 437 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  38.6 
 
 		 256 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  35.85 
 
 		 231 aa  45.8  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  29.01 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 438 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  33.33 
 
 		 438 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  26.02 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  38.24 
 
 		 426 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  23.02 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  38.24 
 
 		 430 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1229  SRA-YDG domain protein  29.6 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  37.5 
 
 		 434 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  38.24 
 
 		 430 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  37.5 
 
 		 430 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  38.24 
 
 		 426 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  38.24 
 
 		 445 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  36.84 
 
 		 466 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  36.84 
 
 		 489 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  38.24 
 
 		 445 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  38.24 
 
 		 430 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2508  hypothetical protein  38.24 
 
 		 441 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0045565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  33.65 
 
 		 462 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  36.84 
 
 		 480 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  36.84 
 
 		 481 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  30.47 
 
 		 358 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  33 
 
 		 313 aa  42.7  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  27.05 
 
 		 255 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  23.03 
 
 		 257 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  32.48 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  32.48 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  31.34 
 
 		 340 aa  42.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11790  hypothetical protein  36.23 
 
 		 418 aa  42.4  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.8127e-48  hitchhiker  0.00000599328 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  25.81 
 
 		 304 aa  42.4  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>