70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4900 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  100 
 
 
291 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  98.63 
 
 
291 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  75.78 
 
 
297 aa  478  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  75.52 
 
 
290 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  75.17 
 
 
290 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  75.17 
 
 
290 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  73.57 
 
 
283 aa  441  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  61.03 
 
 
291 aa  388  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  59.17 
 
 
290 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  45.77 
 
 
289 aa  267  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  36.17 
 
 
298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7809  hypothetical protein  35.05 
 
 
298 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  33.91 
 
 
290 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  32.89 
 
 
304 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2760  restriction endonuclease-like protein  31.4 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  28.1 
 
 
318 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1849  hypothetical protein  29.67 
 
 
304 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00822295  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  26.32 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  27.57 
 
 
323 aa  96.3  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  26.23 
 
 
326 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  26.67 
 
 
374 aa  86.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  30.48 
 
 
496 aa  86.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  37.9 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  34.78 
 
 
265 aa  77  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  29.05 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  30.99 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  36.29 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  32.5 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  25.65 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  28.4 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  36.97 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00960  hypothetical protein  44.32 
 
 
318 aa  65.1  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  35.11 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3178  restriction endonuclease-like protein  31.9 
 
 
213 aa  63.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  31.29 
 
 
256 aa  62.8  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  31.75 
 
 
255 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  31.97 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  31.97 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  33.61 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  28.68 
 
 
345 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  30.22 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  34.45 
 
 
315 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  36.43 
 
 
308 aa  59.7  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  36.43 
 
 
308 aa  59.7  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  39.36 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  29.84 
 
 
257 aa  56.2  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  33.87 
 
 
253 aa  55.8  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  31.39 
 
 
462 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  35.14 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  31.25 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  33.06 
 
 
306 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 
424 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  30.89 
 
 
314 aa  52.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3186  restriction endonuclease-like protein  27.1 
 
 
326 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1577  SRA-YDG domain-containing protein  38.1 
 
 
290 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  30.83 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  28.57 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  31.62 
 
 
263 aa  50.1  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  28.72 
 
 
340 aa  49.3  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  26.99 
 
 
257 aa  49.3  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20450  hypothetical protein with putative HNH endonuclease motif  40.51 
 
 
175 aa  49.3  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  29.57 
 
 
358 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  29.81 
 
 
272 aa  46.2  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0150  HNH endonuclease  36.49 
 
 
223 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.550469  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3143  hypothetical protein  27.59 
 
 
248 aa  45.8  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  39.56 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1229  SRA-YDG domain protein  29.31 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  35 
 
 
231 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3491  SRA-YDG domain-containing protein  31.65 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.205725  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  26.67 
 
 
295 aa  43.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>