50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2760 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2760  restriction endonuclease-like protein  100 
 
 		 304 aa  600  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7809  hypothetical protein  43.14 
 
 		 298 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  41.75 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  43.52 
 
 		 304 aa  182  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  34.75 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  31.74 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  31.4 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  29.08 
 
 		 290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  29.08 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  29.08 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  29.72 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  30.69 
 
 		 291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  30.39 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1849  hypothetical protein  36.07 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00822295  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  29.31 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  28.01 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  34.81 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3178  restriction endonuclease-like protein  40.71 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  24.83 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  43.37 
 
 		 496 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  23.39 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  34.65 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  27.12 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  32.79 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  30.33 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  32.52 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  24.45 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  30.88 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  34.43 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  29.27 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  39.24 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  32.74 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  32.65 
 
 		 306 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  36.79 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20450  hypothetical protein with putative HNH endonuclease motif  38.3 
 
 		 175 aa  50.8  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 424 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  31.73 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3186  restriction endonuclease-like protein  28.81 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  28.26 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  30.47 
 
 		 416 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  40.24 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  31.71 
 
 		 340 aa  46.6  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  32 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00960  hypothetical protein  32.95 
 
 		 318 aa  46.6  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  36.36 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  27.13 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  36.36 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1577  SRA-YDG domain-containing protein  32 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  26.37 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  28.18 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>