45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0273 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  863    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  38.17 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  34.11 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  31.43 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  36.46 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  38.54 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3143  hypothetical protein  34.35 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  41.56 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  30 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  38.1 
 
 		 318 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  32.17 
 
 		 306 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  36.36 
 
 		 323 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  35.64 
 
 		 299 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  37.66 
 
 		 424 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  33.59 
 
 		 299 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5446  hypothetical protein  48.08 
 
 		 108 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  39.02 
 
 		 262 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  38.24 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2760  restriction endonuclease-like protein  30.47 
 
 		 304 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  30.11 
 
 		 315 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  32.2 
 
 		 290 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  30.08 
 
 		 298 aa  47.8  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  36.14 
 
 		 291 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3983  hypothetical protein  30.65 
 
 		 323 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.612254 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  34.57 
 
 		 304 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  26.06 
 
 		 318 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  44 
 
 		 313 aa  47.4  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  28.97 
 
 		 252 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  36.67 
 
 		 265 aa  47  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  29.73 
 
 		 328 aa  47  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  30.09 
 
 		 277 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  28.36 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  31.33 
 
 		 315 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  34.92 
 
 		 180 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  34.69 
 
 		 496 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  34.48 
 
 		 263 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  32.32 
 
 		 231 aa  45.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  27.5 
 
 		 272 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  30.58 
 
 		 290 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  29.63 
 
 		 375 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  32.5 
 
 		 259 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  27.85 
 
 		 313 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2139  hypothetical protein  42.86 
 
 		 310 aa  43.5  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  29.94 
 
 		 290 aa  43.5  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>