32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2139 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2139  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  638    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 		 424 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  39.26 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  32.32 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2553  hypothetical protein  36.23 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  34.62 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  28.99 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3143  hypothetical protein  36.89 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  33 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  33 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  38.46 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  36.46 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  30.77 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  33.01 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  30.19 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  41.18 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  43.02 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5446  hypothetical protein  32.67 
 
 		 108 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  27.32 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  32.04 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  36 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0565  hypothetical protein  34.71 
 
 		 322 aa  53.5  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  34.41 
 
 		 263 aa  52.8  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  36.05 
 
 		 416 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  29.63 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6708  hypothetical protein  27.18 
 
 		 376 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.292072 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  34.67 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2241  hypothetical protein  30.43 
 
 		 411 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  23.58 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  31.82 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  27.54 
 
 		 271 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2760  restriction endonuclease-like protein  25.15 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>