74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0757 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  728    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  50.41 
 
 		 424 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  46.03 
 
 		 462 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  36.63 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2139  hypothetical protein  44.55 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  41.41 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  38.69 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2553  hypothetical protein  39.6 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  42.35 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  40 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  37.93 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  37.5 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  38.17 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  33.85 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  35.61 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  39.32 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  37.93 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  42.39 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5446  hypothetical protein  39.33 
 
 		 108 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  34.13 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  29.66 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  31.3 
 
 		 257 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  34.78 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  36.21 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  32.28 
 
 		 256 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1724  hypothetical protein  33.05 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.589368  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6708  hypothetical protein  32 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.292072 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  31.75 
 
 		 263 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  32.67 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  31.13 
 
 		 271 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  37.65 
 
 		 253 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  34.62 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  33.86 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  30.71 
 
 		 308 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  29.03 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  28.68 
 
 		 257 aa  50.8  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  35.8 
 
 		 315 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  38.14 
 
 		 290 aa  50.8  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  33.72 
 
 		 308 aa  50.1  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  33.72 
 
 		 308 aa  50.1  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  32.52 
 
 		 315 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  28.57 
 
 		 318 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  39.33 
 
 		 313 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  33.06 
 
 		 265 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  31.09 
 
 		 180 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  32.77 
 
 		 252 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  40.26 
 
 		 277 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  27.61 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  27.61 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3143  hypothetical protein  33.8 
 
 		 248 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  31.58 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2241  hypothetical protein  37.5 
 
 		 411 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  29.57 
 
 		 291 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  33.33 
 
 		 258 aa  46.6  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  28.07 
 
 		 299 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  27.61 
 
 		 290 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  30.2 
 
 		 311 aa  46.2  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20450  hypothetical protein with putative HNH endonuclease motif  33.03 
 
 		 175 aa  45.8  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  30.17 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  34.72 
 
 		 255 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  32.12 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3186  restriction endonuclease-like protein  31.15 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  31.71 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2760  restriction endonuclease-like protein  37.84 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  30.97 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  32.58 
 
 		 295 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  28.57 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0565  hypothetical protein  35.78 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  32.86 
 
 		 326 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  35.14 
 
 		 279 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  28.32 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  34.15 
 
 		 323 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  29.82 
 
 		 283 aa  43.1  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  30.47 
 
 		 304 aa  43.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>