54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1523 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  100 
 
 		 258 aa  530  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  44.13 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  42.68 
 
 		 268 aa  162  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  39.6 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  45.62 
 
 		 180 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  43.87 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  37.88 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  37.01 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6007  putative restriction endonuclease  37.25 
 
 		 334 aa  95.9  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  37.06 
 
 		 277 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  32.02 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  42.19 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  38.1 
 
 		 314 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  44.09 
 
 		 311 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  41.73 
 
 		 313 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  40 
 
 		 315 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  38.4 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  45.65 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  33.67 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0625  hypothetical protein  33.61 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  36 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3983  hypothetical protein  39.69 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.612254 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  39.68 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  49.38 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  44.32 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  41.51 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  40.54 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  35.29 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  29.55 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  34.53 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  37.23 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  34.33 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  35.29 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  42.86 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  30.97 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  30.32 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0090  hypothetical protein  52.38 
 
 		 59 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  38.04 
 
 		 462 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  40.48 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 424 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  38.27 
 
 		 308 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  38.27 
 
 		 308 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  31.78 
 
 		 318 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  33.33 
 
 		 358 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  37.8 
 
 		 313 aa  46.2  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1724  hypothetical protein  30.53 
 
 		 309 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.589368  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4145  hypothetical protein  31.91 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  29.29 
 
 		 299 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  41.94 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  36.49 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  26.32 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  30.97 
 
 		 326 aa  42.7  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  28.68 
 
 		 315 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>