48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4521 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  673    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  49.23 
 
 
323 aa  319  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3983  hypothetical protein  53.11 
 
 
323 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.612254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  42.86 
 
 
311 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  41.61 
 
 
315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  37.23 
 
 
314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  32.77 
 
 
277 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  35.78 
 
 
313 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  42.57 
 
 
375 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  39.42 
 
 
259 aa  99  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  36.36 
 
 
256 aa  95.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  35.61 
 
 
295 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  38.17 
 
 
252 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  33.1 
 
 
304 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  33.67 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  32.41 
 
 
304 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  37.86 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  39.53 
 
 
268 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  39.05 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  34.53 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  30.08 
 
 
345 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  35.88 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0625  hypothetical protein  37.3 
 
 
282 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  40.91 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  30.94 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  42.05 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  41.57 
 
 
260 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  38 
 
 
263 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  40.62 
 
 
253 aa  60.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6007  putative restriction endonuclease  28.99 
 
 
334 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  31.82 
 
 
257 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1365  hypothetical protein  23.97 
 
 
148 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  41.54 
 
 
271 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4145  hypothetical protein  25.86 
 
 
314 aa  55.8  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  24.55 
 
 
257 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  41.67 
 
 
318 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  35.71 
 
 
255 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2311  hypothetical protein  24.66 
 
 
595 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000201823  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  28.67 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  32.58 
 
 
304 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  33.33 
 
 
262 aa  47  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  29.73 
 
 
416 aa  47  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  39.33 
 
 
462 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  34.41 
 
 
307 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  38.1 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  30.97 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
424 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  34.57 
 
 
303 aa  43.1  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>