32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0565 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0565  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  654    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  35.62 
 
 		 307 aa  175  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  44.86 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 424 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  37.61 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  37.14 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  47.22 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  47.22 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  36.5 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2139  hypothetical protein  34.58 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  46.48 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  36 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  35.78 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  39.02 
 
 		 266 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  36.84 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  38.74 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  35.25 
 
 		 496 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  36.25 
 
 		 260 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  41.67 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6708  hypothetical protein  41.25 
 
 		 376 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.292072 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3143  hypothetical protein  33.01 
 
 		 248 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  31.03 
 
 		 255 aa  46.2  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  32.06 
 
 		 265 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  40.24 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5446  hypothetical protein  37.18 
 
 		 108 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  40.48 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  41.43 
 
 		 263 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2241  hypothetical protein  31.96 
 
 		 411 aa  43.9  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  30.12 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  28.35 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  27.81 
 
 		 272 aa  43.5  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>