83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0409 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  550  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  88.59 
 
 		 260 aa  488  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  67.56 
 
 		 256 aa  344  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  63.88 
 
 		 265 aa  342  2.9999999999999997e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  41.09 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  38.52 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  34.5 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  41.2 
 
 		 253 aa  175  9e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  33.58 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  29.37 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  33.14 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  41.18 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  30.22 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  35.43 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  38.52 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  36.13 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  39.37 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  43.96 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  39.47 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  42.7 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  37.04 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  33.87 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  41.51 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  38.54 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  38.54 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  33.33 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3983  hypothetical protein  47.73 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.612254 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  30.69 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  44.44 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  33.85 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  41 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  32.93 
 
 		 496 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6007  putative restriction endonuclease  36.63 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  34.35 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  38 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  32.14 
 
 		 279 aa  62  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  28.89 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0625  hypothetical protein  35.71 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  28.48 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  31.54 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  33.59 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  29.13 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  32.52 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  24.5 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  29.49 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  32.14 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  30.26 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  34.4 
 
 		 313 aa  53.9  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  26.23 
 
 		 313 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  30.61 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  28.15 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  34.23 
 
 		 283 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  31.45 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  31.45 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  31.45 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  29.27 
 
 		 290 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 424 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  36.67 
 
 		 308 aa  52  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  36.67 
 
 		 308 aa  52  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3186  restriction endonuclease-like protein  30.51 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  39.47 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  31.15 
 
 		 289 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  28.57 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  27.04 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  33.75 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  36.47 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0090  hypothetical protein  53.66 
 
 		 59 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  28.87 
 
 		 374 aa  49.3  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  27.89 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  29.03 
 
 		 319 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0565  hypothetical protein  33.33 
 
 		 322 aa  48.9  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  36.36 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  27.56 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  29.17 
 
 		 304 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  30.3 
 
 		 307 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00960  hypothetical protein  28.57 
 
 		 318 aa  45.8  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6708  hypothetical protein  33.33 
 
 		 376 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.292072 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  34.48 
 
 		 416 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  31.71 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2241  hypothetical protein  26.24 
 
 		 411 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  31.71 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>