78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1177 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  100 
 
 
314 aa  644    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0428  hypothetical protein  43.35 
 
 
303 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000560837  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  47.54 
 
 
304 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  44.81 
 
 
311 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  48.76 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  37.23 
 
 
328 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  42.75 
 
 
313 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3983  hypothetical protein  41.54 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.612254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  43.08 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  41.86 
 
 
256 aa  106  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  40.62 
 
 
265 aa  102  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  39.23 
 
 
323 aa  99.8  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  39.69 
 
 
272 aa  96.3  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  43.44 
 
 
375 aa  96.3  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  38.58 
 
 
252 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  39.53 
 
 
180 aa  95.9  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  40.94 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  36.62 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  40.46 
 
 
345 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  39.02 
 
 
268 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  33.16 
 
 
295 aa  92.8  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0625  hypothetical protein  41.46 
 
 
282 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  38.1 
 
 
258 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6007  putative restriction endonuclease  28.48 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  35.53 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  38 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  30.37 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  30.06 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  34.35 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  42.86 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  35.58 
 
 
257 aa  65.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  31.86 
 
 
257 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  37.5 
 
 
253 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  32.17 
 
 
257 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  27.46 
 
 
255 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0927  hypothetical protein  36.56 
 
 
336 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000816157  unclonable  0.00000000000440352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5550  hypothetical protein  27.48 
 
 
454 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.463025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  25.93 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  29.27 
 
 
290 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  29.27 
 
 
290 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  29.27 
 
 
290 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  27.66 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1429  hypothetical protein  28.93 
 
 
167 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.379508  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3435  hypothetical protein  28.77 
 
 
333 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000106103  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  36.36 
 
 
283 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  30.89 
 
 
291 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  22.78 
 
 
318 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  33.33 
 
 
496 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  27.12 
 
 
290 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4145  hypothetical protein  30.43 
 
 
314 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  28.17 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  25.9 
 
 
309 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  26.67 
 
 
297 aa  49.3  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  24.14 
 
 
304 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  33.06 
 
 
289 aa  49.3  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  27.27 
 
 
299 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  25.9 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  30.69 
 
 
374 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  32.11 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  26.19 
 
 
326 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  32.8 
 
 
299 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1849  hypothetical protein  27.1 
 
 
304 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00822295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3799  hypothetical protein  30.22 
 
 
327 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000157836  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3517  hypothetical protein  30.22 
 
 
327 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000550891  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3440  hypothetical protein  31.15 
 
 
327 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000469618  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  25.32 
 
 
298 aa  46.2  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  33.72 
 
 
307 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  26.23 
 
 
326 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  23.44 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20450  hypothetical protein with putative HNH endonuclease motif  35.78 
 
 
175 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  33.33 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  28.85 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  24.59 
 
 
326 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 
424 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  26.21 
 
 
303 aa  43.1  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00960  hypothetical protein  29.25 
 
 
318 aa  42.7  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  26.88 
 
 
319 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0467865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>