14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5550 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5550  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  911    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.463025  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3440  hypothetical protein  39.53 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000469618  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3517  hypothetical protein  37.98 
 
 		 327 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000550891  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3799  hypothetical protein  37.98 
 
 		 327 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000157836  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4145  hypothetical protein  44.88 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3435  hypothetical protein  35.66 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000106103  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0927  hypothetical protein  35.71 
 
 		 336 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000816157  unclonable  0.00000000000440352 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  25.68 
 
 		 298 aa  59.7  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  27.48 
 
 		 314 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7809  hypothetical protein  27.36 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2134  restriction endonuclease-like protein  32.35 
 
 		 431 aa  47  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973341 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  24.81 
 
 		 298 aa  47  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  22.11 
 
 		 297 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  30.07 
 
 		 313 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>