66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5799 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  100 
 
 
283 aa  593  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  97.86 
 
 
290 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  97.5 
 
 
290 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  97.5 
 
 
290 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  79.64 
 
 
297 aa  471  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  73.57 
 
 
291 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  73.21 
 
 
291 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  58.93 
 
 
291 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  56.43 
 
 
290 aa  348  7e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  48.68 
 
 
289 aa  258  9e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  35.92 
 
 
298 aa  186  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7809  hypothetical protein  35.04 
 
 
298 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  36.73 
 
 
290 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  28.01 
 
 
304 aa  119  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2760  restriction endonuclease-like protein  30.29 
 
 
304 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  27.95 
 
 
318 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1849  hypothetical protein  27.5 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00822295  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  24.73 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  24.83 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  31.22 
 
 
496 aa  82.4  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  24.31 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  24.03 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  25.08 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  26.13 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  40.23 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  37.27 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  24.08 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00960  hypothetical protein  30.95 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3178  restriction endonuclease-like protein  34.91 
 
 
213 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  33.7 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  34.33 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  31.88 
 
 
298 aa  62.8  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  30.05 
 
 
263 aa  62.4  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  31.4 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  30.71 
 
 
462 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  32.43 
 
 
256 aa  57.4  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  34.51 
 
 
260 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  35.37 
 
 
345 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  35.85 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  32.5 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  34.23 
 
 
263 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  38.04 
 
 
308 aa  53.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  38.04 
 
 
308 aa  53.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3186  restriction endonuclease-like protein  30.08 
 
 
326 aa  53.1  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  36.36 
 
 
314 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  25.49 
 
 
340 aa  53.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  28.39 
 
 
257 aa  52.4  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  33.93 
 
 
304 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  38.46 
 
 
253 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  27.85 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  34.09 
 
 
271 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3143  hypothetical protein  27.64 
 
 
248 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  32.5 
 
 
308 aa  48.9  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  30.53 
 
 
257 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  30.19 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
424 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  31.13 
 
 
309 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  37.35 
 
 
231 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20450  hypothetical protein with putative HNH endonuclease motif  39.74 
 
 
175 aa  46.6  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  30.19 
 
 
309 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  29.82 
 
 
358 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  34.34 
 
 
306 aa  43.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  28.83 
 
 
268 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1723  HNH endonuclease  30.28 
 
 
407 aa  42.7  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  32.32 
 
 
303 aa  42.4  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  28.4 
 
 
295 aa  42.4  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>