66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2314 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  100 
 
 		 289 aa  607  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  45.77 
 
 		 291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  46.37 
 
 		 290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  46.37 
 
 		 290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  45.07 
 
 		 291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  46.37 
 
 		 290 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  46.69 
 
 		 291 aa  281  9e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  44.56 
 
 		 297 aa  277  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  45.61 
 
 		 290 aa  276  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  48.68 
 
 		 283 aa  275  8e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  38.14 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7809  hypothetical protein  30.48 
 
 		 298 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  31.58 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  27.76 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2760  restriction endonuclease-like protein  26.57 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1849  hypothetical protein  27.46 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00822295  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  28.22 
 
 		 318 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  26.45 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  36.64 
 
 		 496 aa  83.2  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  24.32 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  24.57 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  25.82 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  27.44 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  36.89 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  33.87 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  25.38 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  23.45 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  32.84 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3178  restriction endonuclease-like protein  37.93 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  30.65 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  37.04 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  36.3 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00960  hypothetical protein  35.59 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  34.43 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  32.64 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  31.03 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  34.19 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20450  hypothetical protein with putative HNH endonuclease motif  44.74 
 
 		 175 aa  58.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  31.54 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  31.67 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  27.02 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  30.33 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3186  restriction endonuclease-like protein  31.15 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  27.5 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  30.89 
 
 		 318 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  33.71 
 
 		 340 aa  52.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  33.07 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  29.84 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  28.33 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  30.89 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 424 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  33.06 
 
 		 314 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  32.84 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  32.08 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  28.91 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3143  hypothetical protein  26.89 
 
 		 248 aa  46.2  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  31.03 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  36.14 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  37.14 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  28.42 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  34.94 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  28.95 
 
 		 307 aa  42.7  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1577  SRA-YDG domain-containing protein  32.89 
 
 		 290 aa  42.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>