53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4613 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  56.32 
 
 		 313 aa  285  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  45.77 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  47.29 
 
 		 252 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  48.89 
 
 		 180 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  40.4 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  43.08 
 
 		 314 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  40.44 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  36.46 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  37.14 
 
 		 259 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  32.77 
 
 		 328 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  49.48 
 
 		 375 aa  106  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  47.73 
 
 		 265 aa  105  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  38.52 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3983  hypothetical protein  45.32 
 
 		 323 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.612254 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  44.44 
 
 		 315 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  38.52 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  39.13 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  31.82 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  36.88 
 
 		 279 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  37.06 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  43.17 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  32.13 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0625  hypothetical protein  36.54 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  30.22 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6007  putative restriction endonuclease  38.46 
 
 		 334 aa  82  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  37.59 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  39.44 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  38.61 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  31.03 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  33.85 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  29.23 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  45.16 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  40.62 
 
 		 462 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  42.27 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  30.71 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0090  hypothetical protein  48.94 
 
 		 59 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  41.56 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  31.4 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 424 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  32.03 
 
 		 318 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6708  hypothetical protein  25 
 
 		 376 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.292072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  40.26 
 
 		 358 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  30.09 
 
 		 416 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  25.56 
 
 		 309 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  38.46 
 
 		 313 aa  45.8  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  25.33 
 
 		 303 aa  45.8  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  27.43 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  32.88 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  39.13 
 
 		 437 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  26.25 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  24.81 
 
 		 309 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5446  hypothetical protein  37.14 
 
 		 108 aa  42  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.141898 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>