48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1267 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  94.08 
 
 		 304 aa  570  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  48.76 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  40 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  51.19 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  40.74 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  38.52 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  40 
 
 		 252 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  36.44 
 
 		 268 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  37.1 
 
 		 272 aa  90.5  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  39.17 
 
 		 180 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  37.7 
 
 		 315 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  41.22 
 
 		 279 aa  89  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  37.29 
 
 		 375 aa  89.4  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  36.36 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3983  hypothetical protein  37.5 
 
 		 323 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.612254 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  36.07 
 
 		 323 aa  87  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  32.41 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  39.84 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  36 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0625  hypothetical protein  33.11 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  38.4 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  43.3 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  38.05 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  44.32 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  38.54 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  42.53 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  38.54 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  40 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  35.83 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  34.13 
 
 		 257 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  34.71 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  37.5 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  31.87 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6007  putative restriction endonuclease  29.07 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  32.98 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 424 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  34.57 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0927  hypothetical protein  34.91 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000816157  unclonable  0.00000000000440352 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  22.01 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  28 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4145  hypothetical protein  29.27 
 
 		 314 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3186  restriction endonuclease-like protein  30.71 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7809  hypothetical protein  23.08 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  31.4 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  29.55 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  26.47 
 
 		 299 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3440  hypothetical protein  40.96 
 
 		 327 aa  42.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000469618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>