62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2373 on replicon NC_011667
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  100 
 
 
333 aa  682    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  40.23 
 
 
263 aa  178  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  35.2 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  40.8 
 
 
326 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  31.01 
 
 
318 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  37.8 
 
 
326 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3178  restriction endonuclease-like protein  37.93 
 
 
213 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  28.71 
 
 
323 aa  90.5  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  33.77 
 
 
299 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  46.51 
 
 
496 aa  86.7  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  39.62 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  38.93 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  35.77 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20450  hypothetical protein with putative HNH endonuclease motif  41.12 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  30.13 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  27.44 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  29.88 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  28.4 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  33.33 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  29.45 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  33.81 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  28.83 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  29.45 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  29.45 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  33.83 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7809  hypothetical protein  32.06 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  27.95 
 
 
291 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  31.75 
 
 
290 aa  62.8  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  31.4 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2760  restriction endonuclease-like protein  32.52 
 
 
304 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00960  hypothetical protein  39.24 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  31.45 
 
 
256 aa  56.6  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4752  hypothetical protein  38.53 
 
 
137 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256853  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  39.47 
 
 
297 aa  56.2  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0292  hypothetical protein  37.61 
 
 
141 aa  53.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3186  restriction endonuclease-like protein  31.93 
 
 
326 aa  53.1  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  28.46 
 
 
265 aa  53.1  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  30.09 
 
 
257 aa  52.8  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  31.93 
 
 
255 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  38.37 
 
 
253 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  31.93 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  30.83 
 
 
306 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1959  HNH endonuclease  25.98 
 
 
334 aa  50.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1577  SRA-YDG domain-containing protein  36.11 
 
 
290 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1229  SRA-YDG domain protein  35.48 
 
 
289 aa  49.7  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  27.56 
 
 
263 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1849  hypothetical protein  26.45 
 
 
304 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00822295  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  37.5 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  27.54 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  30.25 
 
 
309 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  33.01 
 
 
304 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  36.49 
 
 
231 aa  47.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  40.3 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  41.38 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3491  SRA-YDG domain-containing protein  27.42 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.205725  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  41.38 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  31.68 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  23.94 
 
 
314 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  27.5 
 
 
309 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  34.55 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  25.26 
 
 
257 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  26.09 
 
 
318 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>