44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6652 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  624  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0565  hypothetical protein  35.62 
 
 		 322 aa  172  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 424 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  45.19 
 
 		 313 aa  86.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  41.41 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  42.31 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  46.84 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  44.06 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  41.49 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  40 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  32.2 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  43.84 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  41.46 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2139  hypothetical protein  34.38 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  40 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  43.84 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  40.66 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6708  hypothetical protein  38.71 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.292072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  41.56 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  34.19 
 
 		 260 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  41.33 
 
 		 231 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5446  hypothetical protein  32.98 
 
 		 108 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2241  hypothetical protein  45.16 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  38.24 
 
 		 416 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  29.51 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  33.09 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  37.66 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  30.3 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  31.62 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  28.95 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  37.33 
 
 		 279 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  27.94 
 
 		 295 aa  45.8  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  34.41 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  33.33 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  35.06 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  25.68 
 
 		 375 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  38.46 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  30.09 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2553  hypothetical protein  33.71 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  28.83 
 
 		 257 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  29.73 
 
 		 257 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  27.66 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  37.33 
 
 		 252 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>