44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0209 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  649    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  42.49 
 
 		 311 aa  255  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3983  hypothetical protein  42.41 
 
 		 323 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.612254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  41.61 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  38.7 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  38.67 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  44.12 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  39.42 
 
 		 259 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  44.44 
 
 		 277 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  36.62 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  46.43 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  39.69 
 
 		 252 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  37.7 
 
 		 304 aa  89.7  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  43.88 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  40 
 
 		 258 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  39.69 
 
 		 180 aa  86.7  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  40.15 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  39.07 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  38.18 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  41.18 
 
 		 263 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  37.31 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  35.43 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  38.1 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  37.82 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  40.44 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6007  putative restriction endonuclease  33.12 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  34.91 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0625  hypothetical protein  30.91 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  33.6 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  34.11 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  32.99 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  32.35 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  29.01 
 
 		 257 aa  53.9  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  33.68 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  42.67 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  32.52 
 
 		 358 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  36.36 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  28.39 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  31.33 
 
 		 416 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  35.23 
 
 		 309 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  34.09 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3440  hypothetical protein  31.43 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000469618  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3517  hypothetical protein  29.63 
 
 		 327 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000550891  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3799  hypothetical protein  29.63 
 
 		 327 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000157836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>