66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3262 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  607  1e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00960  hypothetical protein  40.54 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  39.56 
 
 
308 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  39.56 
 
 
308 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  36.88 
 
 
308 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0819  hypothetical protein  35.81 
 
 
149 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.607304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0835  hypothetical protein  35.81 
 
 
149 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  33.93 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  31.82 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  37.29 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  37.29 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  32.19 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  35.04 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  38.41 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  37.68 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  36.43 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  37.01 
 
 
496 aa  65.9  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3186  restriction endonuclease-like protein  27.82 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  35.11 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  29.55 
 
 
257 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  34.33 
 
 
283 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  35.34 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  38.52 
 
 
318 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  33.88 
 
 
290 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  33.88 
 
 
290 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  33.88 
 
 
290 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  34.75 
 
 
290 aa  62.4  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  34.91 
 
 
313 aa  62.8  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  62.4  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  33.64 
 
 
297 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  30.16 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  35.16 
 
 
299 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  34.19 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7809  hypothetical protein  44.05 
 
 
298 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  37.4 
 
 
462 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  32.52 
 
 
374 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  34.62 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  34.51 
 
 
323 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  34.68 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  32.19 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 
424 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  39.47 
 
 
333 aa  56.2  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  33.6 
 
 
315 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  33.87 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  32.17 
 
 
265 aa  55.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  33.58 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20450  hypothetical protein with putative HNH endonuclease motif  36.96 
 
 
175 aa  54.7  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  28.36 
 
 
271 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  30.25 
 
 
319 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  31.52 
 
 
304 aa  52.8  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  31.15 
 
 
298 aa  52  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3178  restriction endonuclease-like protein  31.9 
 
 
213 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  31.87 
 
 
304 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  39.47 
 
 
263 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  30.28 
 
 
260 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  35.78 
 
 
290 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  36.96 
 
 
263 aa  49.3  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  30 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  28.95 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  28.24 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6708  hypothetical protein  33.73 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.292072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2760  restriction endonuclease-like protein  36.36 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  35 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  40.28 
 
 
231 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  32.94 
 
 
262 aa  43.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  32.22 
 
 
268 aa  42.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>