57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7809 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7809  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  596  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  58.25 
 
 		 290 aa  332  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1849  hypothetical protein  49 
 
 		 304 aa  264  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00822295  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  38.59 
 
 		 298 aa  191  9e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2760  restriction endonuclease-like protein  44.21 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  36.77 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  39.73 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  35.4 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  35.05 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  34.93 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  30.48 
 
 		 289 aa  159  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  34.59 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  34.59 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  35.15 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  34.59 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  35.04 
 
 		 283 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  28.06 
 
 		 374 aa  88.6  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  27.76 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  24.83 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  24.2 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  26.9 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  25.78 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  25.55 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  36.15 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  32.06 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  30 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  33.06 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  30.33 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  44.05 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  24.53 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  31.45 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  35.8 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3186  restriction endonuclease-like protein  32.56 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5550  hypothetical protein  27.36 
 
 		 454 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.463025  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00960  hypothetical protein  42.86 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  30.58 
 
 		 315 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  32.52 
 
 		 318 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  26.61 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  29.58 
 
 		 496 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20450  hypothetical protein with putative HNH endonuclease motif  39.44 
 
 		 175 aa  52.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  30.95 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  26.02 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  32.48 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3178  restriction endonuclease-like protein  31.15 
 
 		 213 aa  50.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  30.71 
 
 		 256 aa  49.7  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  29.51 
 
 		 306 aa  49.3  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 		 424 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  30.77 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  33.82 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  36.47 
 
 		 308 aa  45.8  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  36.47 
 
 		 308 aa  45.8  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  39.47 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  23.08 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  34.09 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  35.53 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  34.85 
 
 		 231 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  28.89 
 
 		 260 aa  42.4  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>